2009-03-01から1ヶ月間の記事一覧

昨日の続き。

でも!あまり好まれていないglmmPQLではできた!idを50にしても。 > fglmmPQL fglmmPQL Linear mixed-effects model fit by maximum likelihood Data: dat2 Log-likelihood: NA Fixed: y2 ~ 1 (Intercept) 0.9502553 Random effects: Formula: ~1 | id (Inte…

glmmとかとか。

というか,正規分布だと個体ごとにデータが1つしかないと,ランダム効果を推測できないのか!?まずポワソン分布の場合。 > a b y id dat fglm fglm Call: glm(formula = y ~ 1, family = poisson, data = dat) Coefficients: (Intercept) 1.834 Degrees of…

Bolker et al. 2009 TREE vol.24の続き。

もちろん一概には言えないが,おおまなかな,,,おおまかな解析の手順が紹介されている。 固定効果・ランダム効果を決める。特に重要そうな交互作用だけも決める。だいたいランダム効果は5-6レベルが推奨,固定効果に対しては10-20ほど。 誤差構造とlink関…

Bolker et al. 2009読み

ふうむ,尤度比検定は固定効果に対してはサンプルサイズが大きくないとオススメできないとな。ランダム効果に対して使えと。

すごいよ。漫画みたいな展開だよ。感動です。

「追記」

勝ったーーーーーー!!!

ぼやき

ベイズを勉強しているとか言うと,実験研究なのに珍しいね。と言われます。 確かに現象を確率変数として捉える性質上,ベイズは野外とか向きのようにも思います。 でも,生物を科学として扱う以上,実験室でもばらつきや変動は(おそらく人為的に制御できる…

生態学会

今回はネタの見通しもたたず,金と時間がない都合上行けなかった。行きたかったけど。。 来年は東京らしいし,集大成として頑張ろう。と思う。

これこれ

ん〜,これからますます普及していきそうですね。リンクGeneralized linear mixed models: a practical guide for ecology and evolution Benjamin M. Bolker, Mollie E. Brooks, Connie J. Clark, Shane W. Geange, John R. Poulsen, M. Henry H. Stevens a…

http://www.toei-anim.co.jp/tv/dragon_kai/ ドラゴンボールがドラゴンボール改になって帰ってくる!! 声優陣がもう一度吹き替えたり,オープニングが変わっていたり多少心配な面もありますが, これから日曜の朝9時がたのしみな限りです。

lek paradox

メスの(方向性)配偶者選択によって,オスの形質の遺伝的変異がなくなるにもかかわらず,メスがえり好みをする遺伝的利益はあるのか? メスの配偶者選択によってオスの形質の相加遺伝分散は減少するのに,子にとっての相加遺伝的利益に基づいてなぜオスを選…